1. Ваш никнейм, сервер: VARERA, TechnoMagic
2. Интересующий вас вопрос: Хочу скрафтить ультимейт энергетический кристалл, но выдает ошибку, что не может скрафтить иридиевый энергетический кристалл из-за заряжающих энергетических кристаллов и так далее. Все автокрафты для этих кристаллов есть. Покопался на форуме и не смог понять,как не тронув кристалл сделать шаблон. Пробовал сделать шаблон через кодировщик шаблонов, а также попытался сделать шаблон вручную(ничего не помогло).
3. Объясните как сделать вручную, не тронув кристалл руками и не беря его в инвентарь или возможны другие варианты решения проблемы.

вытащи кристалл из мэ, не кладя его в инвентарь и положи в нужное место в крафте, после этого кристалл обратно положи в МЭ

Дополню ответ выше.

Закажите закодированный кристалл и после установите именно этот кристалл в слот следующего шаблона. Ни в коем случае не используйте в шаблоне кристаллы которые когда-либо имели заряд/бывали в инвентаре и т.д. Данные кристаллы уже имеют битый NBT-тег